Le hameau d'Ecogia a une longue histoire. La présence d'une source est l'un des intérêts de ce lieu. Déjà les Romains ont profité de cette source pour alimenter un aqueduc qui conduisait l'eau d'Ecogia à une villa romaine située sur le plateau de la gare de Versoix.
Le nom lui-même d'Ecogia apparaît pour la première fois dans un document de 1022 sous la forme d'Adesgogia. Parmi les hypothèses sur l'étymologie de ce nom, le linguiste Ferdinand de Saussure suppose une origine latine : la préposition Ad signifiant "près de" et Esgogia pouvant être dérivé de exagitare, soit "pousser dehors", l'origine du nom ferait clairement allusion à la source.

"Hic sitiens viator - vinum non acqua plus quam" 1824
"Arrête-toi ici, voyageur assoiffé! Le vin n'est pas meilleur que cette eau".

Cette inscription latine figure sur une pierre taillée de style empire en forme de mausolée abritant la source.

Le bâtiment, construit au XVIIIe siècle, est remis en 1881 à un ordre mi-religieux qui y fonde un orphelinat. Lorsque celui-ci cesse ses activités, la commune de Versoix rachète le domaine en juillet 1993. La Municipalité l'a ensuite mis à disposition du CICR dès juin 1999.